Generated synthetic data in medical research can substitute privacy and security-sensitive data with a large-scale curated dataset, reducing data collection and annotation costs. As part of this effort, we propose UniXGen, a unified chest X-ray and report generation model, with the following contributions. First, we design a unified model for bidirectional chest X-ray and report generation by adopting a vector quantization method to discretize chest X-rays into discrete visual tokens and formulating both tasks as sequence generation tasks. Second, we introduce several special tokens to generate chest X-rays with specific views that can be useful when the desired views are unavailable. Furthermore, UniXGen can flexibly take various inputs from single to multiple views to take advantage of the additional findings available in other X-ray views. We adopt an efficient transformer for computational and memory efficiency to handle the long-range input sequence of multi-view chest X-rays with high resolution and long paragraph reports. In extensive experiments, we show that our unified model has a synergistic effect on both generation tasks, as opposed to training only the task-specific models. We also find that view-specific special tokens can distinguish between different views and properly generate specific views even if they do not exist in the dataset, and utilizing multi-view chest X-rays can faithfully capture the abnormal findings in the additional X-rays. The source code is publicly available at: https://github.com/ttumyche/UniXGen.


翻译:在医学研究中,生成的合成数据能够替代涉及隐私和安全敏感的大规模策展数据集,从而降低数据收集和标注成本。为此,我们提出UniXGen——一个统一的胸部X光片与报告生成模型,其贡献如下:首先,通过采用向量量化方法将胸部X光片离散化为视觉标记,并将两项任务均建模为序列生成任务,我们设计了一个用于双向胸部X光片与报告生成的统一模型。其次,我们引入若干特殊标记以生成特定视角的胸部X光片,这在所需视角数据缺失时尤为实用。此外,UniXGen可灵活接受从单视角到多视角的多种输入,从而充分利用其他X光片中包含的额外发现。为处理高分辨率多视角胸部X光片及长段落报告带来的长序列输入,我们采用了一种计算与内存效率兼具的高效Transformer架构。大量实验表明,相较于仅训练特定任务模型,我们的统一模型对两项生成任务均具有协同增强效应。我们还发现,视角专属的特殊标记能有效区分不同视角,并在数据集缺失特定视角的情况下正确生成相应图像;而利用多视角胸部X光片可更准确地捕捉额外X光片中的异常发现。源代码已公开于:https://github.com/ttumyche/UniXGen。

0
下载
关闭预览

相关内容

ACM/IEEE第23届模型驱动工程语言和系统国际会议,是模型驱动软件和系统工程的首要会议系列,由ACM-SIGSOFT和IEEE-TCSE支持组织。自1998年以来,模型涵盖了建模的各个方面,从语言和方法到工具和应用程序。模特的参加者来自不同的背景,包括研究人员、学者、工程师和工业专业人士。MODELS 2019是一个论坛,参与者可以围绕建模和模型驱动的软件和系统交流前沿研究成果和创新实践经验。今年的版本将为建模社区提供进一步推进建模基础的机会,并在网络物理系统、嵌入式系统、社会技术系统、云计算、大数据、机器学习、安全、开源等新兴领域提出建模的创新应用以及可持续性。 官网链接:http://www.modelsconference.org/
专知会员服务
61+阅读 · 2020年3月19日
100+篇《自监督学习(Self-Supervised Learning)》论文最新合集
专知会员服务
167+阅读 · 2020年3月18日
专知会员服务
162+阅读 · 2020年1月16日
[综述]深度学习下的场景文本检测与识别
专知会员服务
78+阅读 · 2019年10月10日
【哈佛大学商学院课程Fall 2019】机器学习可解释性
专知会员服务
105+阅读 · 2019年10月9日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
VCIP 2022 Call for Demos
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年6月6日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
逆强化学习-学习人先验的动机
CreateAMind
16+阅读 · 2019年1月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
【论文】图上的表示学习综述
机器学习研究会
15+阅读 · 2017年9月24日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Arxiv
15+阅读 · 2022年10月27日
Arxiv
126+阅读 · 2020年9月6日
Arxiv
13+阅读 · 2020年8月3日
Meta-Learning to Cluster
Arxiv
18+阅读 · 2019年10月30日
Learning Implicit Fields for Generative Shape Modeling
Arxiv
11+阅读 · 2018年12月6日
Arxiv
19+阅读 · 2018年3月28日
VIP会员
最新内容
ICML 2026 | 自回归Boltzmann生成器重塑分子采样
专知会员服务
0+阅读 · 今天15:55
GNN跨域综述:从消息传递到图基础模型
专知会员服务
0+阅读 · 今天15:53
无人机自主控制与人工智能:系统性综述
专知会员服务
11+阅读 · 今天7:25
巡飞弹与反无人机系统——现代战场的两大支柱
专知会员服务
3+阅读 · 今天6:54
《打造“黄金舰队”》57页报告
专知会员服务
3+阅读 · 今天6:52
《北约数字教官网络发展路径》128页报告
专知会员服务
2+阅读 · 今天6:33
ECCV 2026 | MIMFlow:MIM与归一化流统一图像生成
专知会员服务
7+阅读 · 6月25日
网状网络及其在军事领域的运用
专知会员服务
8+阅读 · 6月25日
无美国参与的欧洲战争方式(万字长文)
专知会员服务
8+阅读 · 6月25日
《国防领域敏感性分析白皮书》
专知会员服务
9+阅读 · 6月25日
相关资讯
VCIP 2022 Call for Demos
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年6月6日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
逆强化学习-学习人先验的动机
CreateAMind
16+阅读 · 2019年1月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
【论文】图上的表示学习综述
机器学习研究会
15+阅读 · 2017年9月24日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员