Large language models are increasingly competent at leveraging scientific knowledge and existing computational tools to execute complex workflows. At present, little information exists on their ability to reconstruct tools when given limited descriptions of such tools. We introduce an evaluation titled ReproBAIT (Reproducing Biological AI Tools), which measures the ability of coding agents to design, implement, and train biological AI tools taken from published research across a range of information access conditions. The coding agent is securely sandboxed without internet access and receives training data, a fixed time and compute budget, and limited information about the tool to replicate. We then score the reproduced biological AI tool based on its performance (tool-specific metrics) on held-out data. We evaluated a set of biological AI tools of varying complexities: ProteinMPNN, an inverse protein folding tool, RFdiffusion3, an all-atom generative diffusion tool, and a closed-source molecular design tool. We institute a methodology to check for memorisation, as the open source tools are likely to be included in models' pretraining corpus. Across a range of leading closed- and open-source coding agents, we find substantial reproduction capability for some selected tools, though limited capability for a highly complex tool. We find moderate evidence consistent with memorisation, varying across coding agents. These results suggest that tool developers need to be increasingly cautious when releasing information about the tools publicly; re-creation of the tool based on such information could undermine a tool's commercial value or invalidate dual-use managed access strategies.


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这个新版本的工具会议系列恢复了从1989年到2012年的50个会议的传统。工具最初是“面向对象语言和系统的技术”,后来发展到包括软件技术的所有创新方面。今天许多最重要的软件概念都是在这里首次引入的。2019年TOOLS 50+1在俄罗斯喀山附近举行,以同样的创新精神、对所有与软件相关的事物的热情、科学稳健性和行业适用性的结合以及欢迎该领域所有趋势和社区的开放态度,延续了该系列。 官网链接:http://tools2019.innopolis.ru/
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