Petascale electron microscopy (EM) datasets push storage, transfer, and downstream analysis toward their current limits. We present a vector-quantized variational autoencoder-based (VQ-VAE) compression framework for EM that spans 16x to 1024x and enables pay-as-you-decode usage: top-only decoding for extreme compression, with an optional Transformer prior that predicts bottom tokens (without changing the compression ratio) to restore texture via feature-wise linear modulation (FiLM) and concatenation; we further introduce an ROI-driven workflow that performs selective high-resolution reconstruction from 1024x-compressed latents only where needed.


翻译:拍字节级别的电子显微镜(EM)数据集将存储、传输及下游分析推向当前技术极限。我们提出一种基于矢量量化变分自编码器(VQ-VAE)的EM压缩框架,支持16倍至1024倍压缩比,并实现按需解码功能:通过仅解码顶层实现极限压缩,同时可选采用Transformer先验模型(在不改变压缩率的前提下)预测底层标记,借助特征线性调制(FiLM)与拼接操作恢复纹理细节;我们进一步引入兴趣区域驱动的工作流程,能够从1024倍压缩的潜在表示中,仅在需要区域执行选择性高分辨率重建。

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