项目名称: 遗传相互作用网络的构建和分析

项目编号: No.31171262

项目类型: 面上项目

立项/批准年度: 2012

项目学科: 生物科学

项目作者: 邓明华

作者单位: 北京大学

项目金额: 60万元

中文摘要: 遗传相互作用也称为基因上位作用(Epstatic interaction), 它表征了基因之间的功能相关性。近年来,高通量的基因敲除和图像显示技术相结合,为定量构建遗传相互作用图谱,进行功能基因组分析提供了大量有效的数据。本项目从遗传相互作用定量实验EMAP数据出发,融合多种高通量数据对相关功能通路(Pathway)和功能模块进行预测;构建遗传相互作用网络预测模型,并将理论预测和实验验证相结合,构建全基因组的遗传相互作用网络,为进一步的功能基因组研究奠定基础。

中文关键词: EMAP实验;网络聚类;低秩矩阵分解;数据融合;上位相互作用

英文摘要:

英文关键词: EMAP Experiment;Network Clustering;low-rank matrix decomposition;Data integration;Epstasis

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