Non-significant randomized control trials can hide subgroups of good responders to experimental drugs, thus hindering subsequent development. Identifying such heterogeneous treatment effects is key for precision medicine and many post-hoc analysis methods have been developed for that purpose. While several benchmarks have been carried out to identify the strengths and weaknesses of these methods, notably for binary and continuous endpoints, similar systematic empirical evaluation of subgroup analysis for time-to-event endpoints are lacking. This work aims to fill this gap by evaluating several subgroup analysis algorithms in the context of time-to-event outcomes, by means of three different research questions: Is there heterogeneity? What are the biomarkers responsible for such heterogeneity? Who are the good responders to treatment? In this context, we propose a new synthetic and semi-synthetic data generation process that allows one to explore a wide range of heterogeneity scenarios with precise control on the level of heterogeneity. We provide an open source Python package, available on Github, containing our generation process and our comprehensive benchmark framework. We hope this package will be useful to the research community for future investigations of heterogeneity of treatment effects and subgroup analysis methods benchmarking.


翻译:无显著性差异的随机对照试验可能隐藏对试验药物有良好响应的亚组,从而阻碍后续研发。识别此类异质性治疗效果是精准医学的关键,为此已开发出多种事后分析方法。尽管已有多个基准测试用于识别这些方法的优劣势(尤其针对二分类和连续型终点指标),但在时间至事件终点指标方面,亚组分析的系统性经验评估仍显不足。本研究旨在通过三类研究问题填补这一空白:是否存在异质性?哪些生物标志物导致了这种异质性?哪些患者对治疗有良好响应?我们据此提出一种新型合成与半合成数据生成流程,可精确控制异质性水平,探索广泛的异质性场景。我们提供开源的Python工具包(托管于Github),包含数据生成流程及完整基准测试框架。期待该工具包能助力研究界未来探究治疗效果异质性与亚组分析方法评估。

0
下载
关闭预览

相关内容

Linux导论,Introduction to Linux,96页ppt
专知会员服务
82+阅读 · 2020年7月26日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
利用动态深度学习预测金融时间序列基于Python
量化投资与机器学习
18+阅读 · 2018年10月30日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
论文浅尝 | 利用 RNN 和 CNN 构建基于 FreeBase 的问答系统
开放知识图谱
11+阅读 · 2018年4月25日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
VIP会员
最新内容
《通过小型无人机系统将情报能力“作战化”》
专知会员服务
3+阅读 · 今天7:28
消耗优势:美军的“精确规模化”概念
专知会员服务
7+阅读 · 6月15日
《离线语言支持系统:面向空战战术决策》
专知会员服务
8+阅读 · 6月15日
相关VIP内容
Linux导论,Introduction to Linux,96页ppt
专知会员服务
82+阅读 · 2020年7月26日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
相关资讯
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
利用动态深度学习预测金融时间序列基于Python
量化投资与机器学习
18+阅读 · 2018年10月30日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
论文浅尝 | 利用 RNN 和 CNN 构建基于 FreeBase 的问答系统
开放知识图谱
11+阅读 · 2018年4月25日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
相关基金
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员