This paper addresses complex challenges in histopathological image analysis through three key contributions. Firstly, it introduces a fast patch selection method, FPS, for whole-slide image (WSI) analysis, significantly reducing computational cost while maintaining accuracy. Secondly, it presents PathDino, a lightweight histopathology feature extractor with a minimal configuration of five Transformer blocks and only 9 million parameters, markedly fewer than alternatives. Thirdly, it introduces a rotation-agnostic representation learning paradigm using self-supervised learning, effectively mitigating overfitting. We also show that our compact model outperforms existing state-of-the-art histopathology-specific vision transformers on 12 diverse datasets, including both internal datasets spanning four sites (breast, liver, skin, and colorectal) and seven public datasets (PANDA, CAMELYON16, BRACS, DigestPath, Kather, PanNuke, and WSSS4LUAD). Notably, even with a training dataset of 6 million histopathology patches from The Cancer Genome Atlas (TCGA), our approach demonstrates an average 8.5% improvement in patch-level majority vote performance. These contributions provide a robust framework for enhancing image analysis in digital pathology, rigorously validated through extensive evaluation. Project Page: https://rhazeslab.github.io/PathDino-Page/


翻译:本文通过三大贡献解决组织病理学图像分析中的复杂挑战。首先,针对全切片图像(WSI)分析,提出快速斑块筛选方法FPS,在维持精度的同时显著降低计算成本。其次,构建轻量级组织病理学特征提取器PathDino,采用仅含5个Transformer模块的最小配置,参数规模仅900万,远低于现有方案。第三,引入基于自监督学习的旋转不变表征学习范式,有效缓解过拟合问题。研究表明,我们的紧凑模型在12个多样化数据集上均超越现有最先进的组织病理学专用视觉Transformer,涵盖4个内部数据集(乳腺、肝脏、皮肤和结直肠)及7个公共数据集(PANDA、CAMELYON16、BRACS、DigestPath、Kather、PanNuke和WSSS4LUAD)。值得注意的是,即便使用来自癌症基因组图谱(TCGA)的600万组织病理学斑块进行训练,本方法在斑块级多数投票性能上仍实现平均8.5%的提升。上述贡献为增强数字病理学图像分析提供了可靠框架,并通过广泛评估得到严格验证。项目页面:https://rhazeslab.github.io/PathDino-Page/

0
下载
关闭预览

相关内容

Linux导论,Introduction to Linux,96页ppt
专知会员服务
82+阅读 · 2020年7月26日
FlowQA: Grasping Flow in History for Conversational Machine Comprehension
专知会员服务
35+阅读 · 2019年10月18日
Stabilizing Transformers for Reinforcement Learning
专知会员服务
61+阅读 · 2019年10月17日
《DeepGCNs: Making GCNs Go as Deep as CNNs》
专知会员服务
32+阅读 · 2019年10月17日
Keras François Chollet 《Deep Learning with Python 》, 386页pdf
专知会员服务
164+阅读 · 2019年10月12日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
From Softmax to Sparsemax-ICML16(1)
KingsGarden
74+阅读 · 2016年11月26日
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
Learning Embedding Adaptation for Few-Shot Learning
Arxiv
17+阅读 · 2018年12月10日
Arxiv
11+阅读 · 2018年4月8日
VIP会员
最新内容
博士论文 | 面向大模型推理的内存高效算法
专知会员服务
0+阅读 · 今天15:20
美空军新型反无人机部队初探
专知会员服务
4+阅读 · 今天5:45
《防空交战流程的概率建模研究》
专知会员服务
6+阅读 · 今天5:04
ICML 2026 教程 | 数值优化理论还重要吗?
专知会员服务
4+阅读 · 7月26日
ICM 2026 | 陶哲轩:人工智能时代的数学
专知会员服务
8+阅读 · 7月26日
《反无人机交战场景下的战斗归零研究》
专知会员服务
7+阅读 · 7月26日
博士论文 | 用代码结构感知方法推进代码大模型
相关VIP内容
相关资讯
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
From Softmax to Sparsemax-ICML16(1)
KingsGarden
74+阅读 · 2016年11月26日
相关基金
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员