Spatial transcriptomics jointly captures molecular state, tissue morphology, and spatial organization, yet spatial-domain methods are typically compared only at late training checkpoints, obscuring differences in convergence efficiency. We introduce MP-MNCA, a morphology-prior masked neighbor cross-attention framework that preserves the full 3,000 dimensional highly-variable-gene representation while selectively routing molecular information across spatial neighbors, with histological similarity incorporated as a continuous attention prior under a self-supervised masked neighbor-contrastive objective. Across 12 heterogeneous human dorsolateral prefrontal cortex (DLPFC) sections, MP-MNCA is evaluated against established spatial-domain baselines using both convergence trajectories and epoch-wise spatial-domain visualizations. Our results show that MP-MNCA (i) reaches coherent spatial-domain structure in substantially fewer training epochs, as reflected quantitatively by convergence curves and qualitatively by progressive spatial grids, and (ii) maintains strong clustering quality, achieving a mean peak refined ARI of 0.546 versus 0.549 for the strongest baseline (STAIG), while attaining the highest mean refined NMI of 0.657 versus 0.640. Moreover, MP-MNCA outperforms STAIG on 7 of 12 sections in ARI and 11 of 12 in NMI, demonstrating faster convergence without sacrificing spatial-domain quality.


翻译:暂无翻译

0
下载
关闭预览

相关内容

专知会员服务
39+阅读 · 2021年6月13日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
论文浅尝 | Improved Neural Relation Detection for KBQA
开放知识图谱
13+阅读 · 2018年1月21日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
国家自然科学基金
23+阅读 · 2016年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2014年12月31日
VIP会员
最新内容
软件定义无人机蜂群给防空带来全新压力
专知会员服务
7+阅读 · 10月13日
《半自主无人地面战车的互操作性》66页
专知会员服务
7+阅读 · 10月13日
迈向更智慧的军事情报
专知会员服务
7+阅读 · 10月12日
《美国陆军2026年野战手册 2-0 情报》
专知会员服务
6+阅读 · 10月12日
《基于启发式算法求解武器-目标分配问题》
专知会员服务
7+阅读 · 10月12日
《美陆军最新条令出版物 2-0 情报》
专知会员服务
9+阅读 · 10月10日
电子战测试与训练靶场:战前验证战备状态
专知会员服务
3+阅读 · 10月10日
《美国陆军如何作战》46页最新报告
专知会员服务
10+阅读 · 10月10日
相关VIP内容
专知会员服务
39+阅读 · 2021年6月13日
相关基金
国家自然科学基金
23+阅读 · 2016年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员