项目名称: 基于生物学调控网络的肺癌多平台组学数据的整合分析方法研究
项目编号: No.81402764
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 医药、卫生
项目作者: 魏永越
作者单位: 南京医科大学
项目金额: 23万元
中文摘要: 在我国恶性肿瘤的病死率中,肺癌位居首位。近年来基因组学、转录组学、蛋白组学等多“组学”正进一步揭示肺癌发生机制。肺癌作为众所周知的复杂疾病,涉及到多个基因、多类环境因素,及复杂的相互作用,使得“组学”间既存在重叠,又充分互补。能否充分利用生物学信息,整合多“组学”数据,进一步提高肺癌关联基因识别效能?是本课题面对的主要问题。现有整合方法主要存3类局限:(1) 要求每例样本同时具有多平台试验数据;(2)未充分利用生物学信息;或(3)仅从生物学角度进行功能注释而缺乏统计学证据。科学家普遍认为,真正的肺癌遗传致病因素可能是多基因构成的网络,这个“功能网络”上的任意一点发生改变,皆可能导致肺癌的发生。本研究拟提出基于生物学调控网络整合相对“独立”的多“组学”数据,充分利用生物学信息,基于贝叶斯理论进行网络传播以更高效的方式识别新的关联基因或网络,能够有效克服上述局限,具有重要的科学意义和实用价值。
中文关键词: 中介分析;多组学整合分析;ARDS;风险及预后;LRRC16A
英文摘要: In China, lung cancer is the leading cause of death among all types of cancers. In recent years, the genomic studies including Genome-wide association studies and Next Generation Sequencing (NGS) techniques have identified dozens of lung cancer susceptibi
英文关键词: mediation analysis;multi-omics integrative analysis;ARDS;risk and prognosis;LRRC16A