项目名称: 增加高通量DNA测序阅读长度方法研究

项目编号: No.60971018

项目类型: 面上项目

立项/批准年度: 2010

项目学科: 自动化技术、计算机技术

项目作者: 肖鹏峰

作者单位: 东南大学

项目金额: 30万元

中文摘要: 本项目依据具有自主知识产权的循环测序法原理,提出增加序列测定阅读长度的两个新策略,发展我国的高通量DNA 测序技术。在"延长测序引物重新定位测序起点法"中,将上一循环已经测定的一段序列作为新的测序引物的一部分,使新测序引物杂交到上次序列测定的碱基位置,重新定位测序起点开始下一轮回的序列测定;在"缩短测序模板重新定位测序起点法"中,通过限制性内切酶将已经测得DNA碱基序列的模板片段切割掉,再将模板重新连接一段测序引物杂交片段,重新定位测序起点开始下一轮回的序列测定。测序阅读长度的增加可以提高拼接组装效率、拼接序列的准确性,减少测定次数和拼接的计算量,大大降低高通量序列测定的成本。

中文关键词: 高通量DNA测序;循环测序;连接测序;合成测序;

英文摘要:

英文关键词: High-throughput DNA sequencing;Cyclic sequencing;Sequencing-by-ligation;Sequencing-by-synthesis;

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