Non-significant randomized control trials can hide subgroups of good responders to experimental drugs, thus hindering subsequent development. Identifying such heterogeneous treatment effects is key for precision medicine and many post-hoc analysis methods have been developed for that purpose. While several benchmarks have been carried out to identify the strengths and weaknesses of these methods, notably for binary and continuous endpoints, similar systematic empirical evaluation of subgroup analysis for time-to-event endpoints are lacking. This work aims to fill this gap by evaluating several subgroup analysis algorithms in the context of time-to-event outcomes, by means of three different research questions: Is there heterogeneity? What are the biomarkers responsible for such heterogeneity? Who are the good responders to treatment? In this context, we propose a new synthetic and semi-synthetic data generation process that allows one to explore a wide range of heterogeneity scenarios with precise control on the level of heterogeneity. We provide an open source Python package, available on Github, containing our generation process and our comprehensive benchmark framework. We hope this package will be useful to the research community for future investigations of heterogeneity of treatment effects and subgroup analysis methods benchmarking.


翻译:非显著的随机对照试验可能隐藏实验药物的良好应答者亚组,从而阻碍后续开发。识别此类异质性治疗效果是精准医学的关键,为此已开发出多种事后分析方法。尽管已有若干基准实验用于识别这些方法的优缺点(尤其是针对二元和连续终点),但针对时间至事件终点的亚组分析缺乏类似的系统性实证评估。本研究旨在填补这一空白,通过三个不同研究问题评估时间至事件结局场景下的多种亚组分析算法:是否存在异质性?导致异质性的生物标志物是什么?谁是治疗的良好应答者?为此,我们提出一种新的合成与半合成数据生成过程,可精确控制异质程度以探索广泛的异质性场景。我们提供开源的Python软件包(代码托管于GitHub),其中包含数据生成过程及全面的基准测试框架。希望该软件包能助力研究社区未来开展治疗效果异质性及亚组分析方法基准测试的探索。

0
下载
关闭预览

相关内容

Linux导论,Introduction to Linux,96页ppt
专知会员服务
82+阅读 · 2020年7月26日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
利用动态深度学习预测金融时间序列基于Python
量化投资与机器学习
18+阅读 · 2018年10月30日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
论文浅尝 | 利用 RNN 和 CNN 构建基于 FreeBase 的问答系统
开放知识图谱
11+阅读 · 2018年4月25日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Arxiv
1+阅读 · 2024年2月28日
Arxiv
0+阅读 · 2024年2月28日
VIP会员
最新内容
乌军利用美国“黄蜂”无人机摧毁俄军后勤
专知会员服务
4+阅读 · 6月7日
《支持作战级人机协同智能的交互式OODA流程》
专知会员服务
10+阅读 · 6月7日
ICML 2026 | SARDI:扩散语言模型的自增强检索
专知会员服务
8+阅读 · 6月6日
《国防领域安全采用大语言模型的战略蓝图》
专知会员服务
11+阅读 · 6月6日
ICML 2026 | 演化选择的因果建模
专知会员服务
11+阅读 · 6月5日
综述|学习式3D表征最新进展与趋势
专知会员服务
7+阅读 · 6月5日
相关VIP内容
Linux导论,Introduction to Linux,96页ppt
专知会员服务
82+阅读 · 2020年7月26日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
相关资讯
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
利用动态深度学习预测金融时间序列基于Python
量化投资与机器学习
18+阅读 · 2018年10月30日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
论文浅尝 | 利用 RNN 和 CNN 构建基于 FreeBase 的问答系统
开放知识图谱
11+阅读 · 2018年4月25日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
相关基金
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员