It can be challenging to perform an integrative statistical analysis of multi-view high-dimensional data acquired from different experiments on each subject who participated in a joint study. Canonical Correlation Analysis (CCA) is a statistical procedure for identifying relationships between such data sets. In that context, Structured Sparse CCA (ScSCCA) is a rapidly emerging methodological area that aims for robust modeling of the interrelations between the different data modalities by assuming the corresponding CCA directional vectors to be sparse. Although it is a rapidly growing area of statistical methodology development, there is a need for developing related methodologies in the Bayesian paradigm. In this manuscript, we propose a novel ScSCCA approach where we employ a Bayesian infinite factor model and aim to achieve robust estimation by encouraging sparsity in two different levels of the modeling framework. Firstly, we utilize a multiplicative Half-Cauchy process prior to encourage sparsity at the level of the latent variable loading matrices. Additionally, we promote further sparsity in the covariance matrix by using graphical horseshoe prior or diagonal structure. We conduct multiple simulations to compare the performance of the proposed method with that of other frequently used CCA procedures, and we apply the developed procedures to analyze multi-omics data arising from a breast cancer study.


翻译:对参与联合研究的每位受试者从不同实验中获取的多视图高维数据进行整合统计分析可能具有挑战性。典型相关分析(CCA)是一种用于识别此类数据集之间关系的统计方法。在此背景下,结构化稀疏CCA(ScSCCA)是一个快速兴起的方法学领域,旨在通过假设相应的CCA方向向量具有稀疏性,对不同数据模态之间的相互关系进行稳健建模。尽管这是一个快速发展的统计方法学领域,但在贝叶斯范式下开发相关方法仍存在需求。本文提出一种新颖的ScSCCA方法,采用贝叶斯无限因子模型,通过在建模框架的两个不同层次引入稀疏性来实现稳健估计。首先,我们利用乘性半柯西过程先验在潜变量载荷矩阵层面促进稀疏性。其次,通过使用图形马蹄先验或对角结构进一步强化协方差矩阵的稀疏性。我们通过多重模拟将所提方法与其它常用CCA程序的性能进行比较,并将所开发程序应用于分析来自乳腺癌研究的多组学数据。

0
下载
关闭预览

相关内容

FlowQA: Grasping Flow in History for Conversational Machine Comprehension
专知会员服务
35+阅读 · 2019年10月18日
Stabilizing Transformers for Reinforcement Learning
专知会员服务
61+阅读 · 2019年10月17日
《DeepGCNs: Making GCNs Go as Deep as CNNs》
专知会员服务
32+阅读 · 2019年10月17日
Keras François Chollet 《Deep Learning with Python 》, 386页pdf
专知会员服务
164+阅读 · 2019年10月12日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Hierarchical Imitation - Reinforcement Learning
CreateAMind
19+阅读 · 2018年5月25日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
18+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
The Missing U for Efficient Diffusion Models
Arxiv
0+阅读 · 2023年12月15日
Arxiv
0+阅读 · 2023年12月14日
Adversarial Mutual Information for Text Generation
Arxiv
13+阅读 · 2020年6月30日
Arxiv
18+阅读 · 2019年3月28日
VIP会员
最新内容
面向国防作战的最佳自主与蜂群无人机技术
专知会员服务
7+阅读 · 7月28日
《异构人类团队的协作决策过程混合建模研究》
博士论文 | 面向大模型推理的内存高效算法
专知会员服务
5+阅读 · 7月27日
美空军新型反无人机部队初探
专知会员服务
9+阅读 · 7月27日
《防空交战流程的概率建模研究》
专知会员服务
12+阅读 · 7月27日
ICML 2026 教程 | 数值优化理论还重要吗?
专知会员服务
7+阅读 · 7月26日
ICM 2026 | 陶哲轩:人工智能时代的数学
专知会员服务
10+阅读 · 7月26日
相关资讯
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Hierarchical Imitation - Reinforcement Learning
CreateAMind
19+阅读 · 2018年5月25日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
相关基金
国家自然科学基金
2+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
18+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员