The partial conjunction null hypothesis is tested in order to discover a signal that is present in multiple studies. The standard approach of carrying out a multiple test procedure on the partial conjunction (PC) $p$-values can be extremely conservative. We suggest alleviating this conservativeness, by eliminating many of the conservative PC $p$-values prior to the application of a multiple test procedure. This leads to the following two step procedure: first, select the set with PC $p$-values below a selection threshold; second, within the selected set only, apply a family-wise error rate or false discovery rate controlling procedure on the conditional PC $p$-values. The conditional PC $p$-values are valid if the null p-values are uniform and the combining method is Fisher. The proof of their validity is based on a novel inequality in hazard rate order of partial sums of order statistics which may be of independent interest. We also provide the conditions for which the false discovery rate controlling procedures considered will be below the nominal level. We demonstrate the potential usefulness of our novel method, CoFilter (conditional testing after filtering), for analyzing multiple genome wide association studies of Crohn's disease.


翻译:部分合取零假设的检验旨在发现存在于多项研究中的信号。对部分合取(PC)$p$值执行多重检验程序的标准方法可能极为保守。我们建议通过在应用多重检验程序前剔除大量保守的PC $p$值来缓解这种保守性。这引出了以下两步程序:首先,筛选出PC $p$值低于选择阈值的集合;其次,仅在筛选后的集合中,对条件PC $p$值应用控制族错误率或错误发现率的程序。当零假设$p$值服从均匀分布且合并方法为Fisher时,条件PC $p$值是有效的。其有效性证明基于顺序统计量部分和在风险率序上的一个新不等式,该不等式可能具有独立的理论价值。我们还提供了所考虑的几种错误发现率控制程序低于名义水平的条件。通过分析多个克罗恩病全基因组关联研究,我们证明了新方法CoFilter(过滤后条件检验)的潜在实用价值。

0
下载
关闭预览

相关内容

【ACL2020】多模态信息抽取,365页ppt
专知会员服务
151+阅读 · 2020年7月6日
自动结构变分推理,Automatic structured variational inference
专知会员服务
41+阅读 · 2020年2月10日
Keras François Chollet 《Deep Learning with Python 》, 386页pdf
专知会员服务
164+阅读 · 2019年10月12日
强化学习最新教程,17页pdf
专知会员服务
182+阅读 · 2019年10月11日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
基于深度元学习的因果推断新方法
图与推荐
12+阅读 · 2020年7月21日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
利用动态深度学习预测金融时间序列基于Python
量化投资与机器学习
18+阅读 · 2018年10月30日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
CNN 反向传播算法推导
统计学习与视觉计算组
30+阅读 · 2017年12月29日
可解释的CNN
CreateAMind
18+阅读 · 2017年10月5日
Layer Normalization原理及其TensorFlow实现
深度学习每日摘要
32+阅读 · 2017年6月17日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Arxiv
69+阅读 · 2022年9月7日
Arxiv
16+阅读 · 2022年5月17日
Arxiv
18+阅读 · 2021年3月16日
Recent advances in deep learning theory
Arxiv
52+阅读 · 2020年12月20日
A survey on deep hashing for image retrieval
Arxiv
15+阅读 · 2020年6月10日
VIP会员
最新内容
以色列军事技术对美国军力发展的持续性赋能
专知会员服务
3+阅读 · 今天8:46
《深度强化学习在兵棋推演中的应用》40页报告
专知会员服务
7+阅读 · 今天5:37
《多域作战面临复杂现实》
专知会员服务
6+阅读 · 今天5:35
《印度的多域作战:条令与能力发展》报告
专知会员服务
2+阅读 · 今天5:24
人工智能赋能无人机:俄乌战争(万字长文)
专知会员服务
6+阅读 · 4月23日
国外海军作战管理系统与作战训练系统
专知会员服务
3+阅读 · 4月23日
相关资讯
基于深度元学习的因果推断新方法
图与推荐
12+阅读 · 2020年7月21日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
利用动态深度学习预测金融时间序列基于Python
量化投资与机器学习
18+阅读 · 2018年10月30日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
CNN 反向传播算法推导
统计学习与视觉计算组
30+阅读 · 2017年12月29日
可解释的CNN
CreateAMind
18+阅读 · 2017年10月5日
Layer Normalization原理及其TensorFlow实现
深度学习每日摘要
32+阅读 · 2017年6月17日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员