A retinal trait, or phenotype, summarises a specific aspect of a retinal image in a single number. This can then be used for further analyses, e.g. with statistical methods. However, reducing an aspect of a complex image to a single, meaningful number is challenging. Thus, methods for calculating retinal traits tend to be complex, multi-step pipelines that can only be applied to high quality images. This means that researchers often have to discard substantial portions of the available data. We hypothesise that such pipelines can be approximated with a single, simpler step that can be made robust to common quality issues. We propose Deep Approximation of Retinal Traits (DART) where a deep neural network is used predict the output of an existing pipeline on high quality images from synthetically degraded versions of these images. We demonstrate DART on retinal Fractal Dimension (FD) calculated by VAMPIRE, using retinal images from UK Biobank that previous work identified as high quality. Our method shows very high agreement with FD VAMPIRE on unseen test images (Pearson r=0.9572). Even when those images are severely degraded, DART can still recover an FD estimate that shows good agreement with FD VAMPIRE obtained from the original images (Pearson r=0.8817). This suggests that our method could enable researchers to discard fewer images in the future. Our method can compute FD for over 1,000img/s using a single GPU. We consider these to be very encouraging initial results and hope to develop this approach into a useful tool for retinal analysis.


翻译:视网膜特性( phenotype) 将视网膜图象的某个特定方面归纳成一个单一数字。 然后, 它可以用来进行进一步的分析, 例如用统计方法。 但是, 将复杂图象的一个方面降为一个单一的、 有意义的数字是具有挑战性的。 因此, 计算视网膜特性的方法往往很复杂, 多步管道, 只能用于高质量的图像。 这意味着研究人员往往不得不丢弃大量可用数据。 我们假设, 这种管道可以用一个单一的、 更简单的步骤来接近于共同质量问题。 我们提议在使用深神经网络的情况下, 将一个复杂图象的某个方面降为单一的、 有意义的数字。 我们演示由 VAMPIRI 计算出来的视网状红线性红外线的多步管( FDRP), 可以考虑我们先前发现为高质量的正轨图。 我们的方法显示, 与FD VMPIRE 的一致程度非常高, 在使用原始的图象分析方法时, 将这种原始的图状显示一个退化法。

0
下载
关闭预览

相关内容

【2022新书】高效深度学习,Efficient Deep Learning Book
专知会员服务
128+阅读 · 2022年4月21日
强化学习最新教程,17页pdf
专知会员服务
182+阅读 · 2019年10月11日
[综述]深度学习下的场景文本检测与识别
专知会员服务
78+阅读 · 2019年10月10日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Tutorial
中国图象图形学学会CSIG
3+阅读 · 2021年12月20日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Workshop
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年12月20日
【ICIG2021】Check out the hot new trailer of ICIG2021 Symposium8
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年11月16日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Plenary Talk1
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年11月1日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Industry Talk2
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年7月29日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Industry Talk1
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年7月28日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
无监督元学习表示学习
CreateAMind
27+阅读 · 2019年1月4日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Arxiv
0+阅读 · 2022年9月6日
Arxiv
0+阅读 · 2022年9月3日
Arxiv
10+阅读 · 2021年2月18日
A Multi-Objective Deep Reinforcement Learning Framework
VIP会员
最新内容
非对称优势:美海军开发低成本反无人机技术
专知会员服务
1+阅读 · 今天4:39
《美战争部小企业创新研究(SBIR)计划》
专知会员服务
3+阅读 · 今天2:48
《军事模拟:将军事条令与目标融入AI智能体》
专知会员服务
5+阅读 · 今天2:43
【NTU博士论文】3D人体动作生成
专知会员服务
5+阅读 · 4月24日
以色列军事技术对美国军力发展的持续性赋能
专知会员服务
8+阅读 · 4月24日
《深度强化学习在兵棋推演中的应用》40页报告
专知会员服务
12+阅读 · 4月24日
《多域作战面临复杂现实》
专知会员服务
9+阅读 · 4月24日
《印度的多域作战:条令与能力发展》报告
专知会员服务
4+阅读 · 4月24日
相关资讯
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Tutorial
中国图象图形学学会CSIG
3+阅读 · 2021年12月20日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Workshop
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年12月20日
【ICIG2021】Check out the hot new trailer of ICIG2021 Symposium8
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年11月16日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Plenary Talk1
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年11月1日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Industry Talk2
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年7月29日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Industry Talk1
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年7月28日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
无监督元学习表示学习
CreateAMind
27+阅读 · 2019年1月4日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员