项目名称： 利用禽双链RNA病毒感染瞬间的细胞转录组测序挖掘协助或抵抗病毒进入的基因表达调控网络

项目编号： No.31502084

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2016

项目学科： 水产学、兽医学

项目作者： 胡伯里

作者单位： 南京农业大学

项目金额： 20万元

中文摘要： 目前已有许多研究关注病毒与宿主细胞的互作，但病毒如何在接触细胞膜过程中影响细胞内的信号通路和代谢途径未见有系统的研究。本研究拟以不带囊膜的禽双链RNA病毒和带囊膜的低致病性禽流感病毒IAV为模型，利用RNA-Seq技术检测IBDV和IAV结合细胞膜时对细胞基因表达，基因产生，蛋白质编码，异常转录本产生和融合基因出现变化的情况，分析在细胞内吞作用阻断的而抑制病毒进入细胞的情况下病毒对细胞基因转录的影响，以了解病毒接触细胞时是否激活了细胞的抗病毒反应或者通过信号传递引发有利于病毒侵入或复制的变化，以及囊膜病毒和非囊魔病毒在这一过程中的异同。上述研究所发现新的候选基因以及信号通路可以为开发用于阻断病毒结合和侵入细胞的抗病毒药物提供新的研发思路和直接的药物靶标。

中文关键词： 家禽；转录组测序；先天性免疫；病毒进入；基因调控网络

英文摘要： A lot of study focus on the interaction between virus and host cells, but comprehensive global gene expression analysis of cells upon attachment of virus on cell membrane is till lack. Our study will foucus on the transcriptome of cells upon attachment of non-enveloped virus IBDV or enveloped virus IAV on cell membrane when the endocytosis is inhibited. It’s worth to expect that change of global expression profiles of cells in response to attachment of virus will be unveiled. From the data we may find the candidate signal pathways or genes benefit or harmful for infection at first stage of virus invading, which may provide new potential opportunities for therapeutic intervention in interfering the attachment and entry of virus.

英文关键词： Fowl; RNA-Seq;Innate immunity;Viral entry;gene regulatory network