Multiple Instance Learning (MIL) and transformers are increasingly popular in histopathology Whole Slide Image (WSI) classification. However, unlike human pathologists who selectively observe specific regions of histopathology tissues under different magnifications, most methods do not incorporate multiple resolutions of the WSIs, hierarchically and attentively, thereby leading to a loss of focus on the WSIs and information from other resolutions. To resolve this issue, we propose a Hierarchical Attention-Guided Multiple Instance Learning framework to fully exploit the WSIs. This framework can dynamically and attentively discover the discriminative regions across multiple resolutions of the WSIs. Within this framework, an Integrated Attention Transformer is proposed to further enhance the performance of the transformer and obtain a more holistic WSI (bag) representation. This transformer consists of multiple Integrated Attention Modules, which is the combination of a transformer layer and an aggregation module that produces a bag representation based on every instance representation in that bag. The experimental results show that our method achieved state-of-the-art performances on multiple datasets, including Camelyon16, TCGA-RCC, TCGA-NSCLC, and an in-house IMGC dataset. The code is available at https://github.com/BearCleverProud/HAG-MIL.


翻译:多实例学习(MIL)和Transformer在组织病理学全切片图像(WSI)分类中日益流行。然而,与人类病理学家在不同放大倍数下选择性地观察组织病理学组织特定区域不同,大多数方法未能以分层且注意力的方式整合WSI的多分辨率信息,导致对WSI的关注焦点缺失及其他分辨率信息的丢失。为解决此问题,我们提出了一种分层注意力引导的多实例学习框架,以充分利用WSI。该框架能够动态且注意力地发现WSI多分辨率中的判别性区域。在该框架内,我们进一步提出了一种集成注意力Transformer,以增强Transformer的性能并获得更全局的WSI(包)表示。该Transformer由多个集成注意力模块组成,每个模块结合了一个Transformer层和一个聚合模块,基于包中每个实例表示生成包表示。实验结果表明,我们的方法在多个数据集上取得了最先进的性能,包括Camelyon16、TCGA-RCC、TCGA-NSCLC以及内部IMGC数据集。代码已开源:https://github.com/BearCleverProud/HAG-MIL。

0
下载
关闭预览

相关内容

FlowQA: Grasping Flow in History for Conversational Machine Comprehension
专知会员服务
34+阅读 · 2019年10月18日
Stabilizing Transformers for Reinforcement Learning
专知会员服务
60+阅读 · 2019年10月17日
《DeepGCNs: Making GCNs Go as Deep as CNNs》
专知会员服务
32+阅读 · 2019年10月17日
Keras François Chollet 《Deep Learning with Python 》, 386页pdf
专知会员服务
164+阅读 · 2019年10月12日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
论文浅尝 | Question Answering over Freebase
开放知识图谱
19+阅读 · 2018年1月9日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
From Softmax to Sparsemax-ICML16(1)
KingsGarden
74+阅读 · 2016年11月26日
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
Arxiv
13+阅读 · 2017年12月5日
VIP会员
最新内容
美国从乌克兰无人机战争中学习经验
专知会员服务
1+阅读 · 今天15:03
ICML 2026 | 面向视觉语言模型的语义鲁棒性认证
专知会员服务
0+阅读 · 今天14:31
学习数据的几何:形状空间分析数学综述
专知会员服务
8+阅读 · 6月17日
定向能反无人机系统最新发展动态
专知会员服务
10+阅读 · 6月17日
相关资讯
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
论文浅尝 | Question Answering over Freebase
开放知识图谱
19+阅读 · 2018年1月9日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
From Softmax to Sparsemax-ICML16(1)
KingsGarden
74+阅读 · 2016年11月26日
相关基金
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员