metasnf is an R package that enables users to apply meta clustering, a method for efficiently searching a broad space of cluster solutions by clustering the solutions themselves, to clustering workflows based on similarity network fusion (SNF). SNF is a multi-modal data integration algorithm commonly used for biomedical subtype discovery. The package also contains functions to assist with cluster visualization, characterization, and validation. This package can help researchers identify SNF-derived cluster solutions that are guided by context-specific utility over context-agnostic measures of quality.


翻译:metasnf是一个R语言程序包,支持用户将元聚类方法应用于基于相似性网络融合(SNF)的聚类工作流。元聚类通过将聚类解本身作为聚类对象,实现对大规模解空间的高效搜索。SNF是一种常用于生物医学亚型发现的多模态数据整合算法。该程序包还包含辅助聚类可视化、特征描述与验证的功能模块,能够帮助研究者识别基于SNF的聚类解——这些解受特定情境效用的引导,而非通用的质量评估指标。

0
下载
关闭预览

相关内容

Meta-Transformer:多模态学习的统一框架
专知会员服务
59+阅读 · 2023年7月21日
元学习(meta learning) 最新进展综述论文
专知会员服务
281+阅读 · 2020年5月8日
元学习—Meta Learning的兴起
专知
44+阅读 · 2019年10月19日
元学习(Meta Learning)最全论文、视频、书籍资源整理
深度学习与NLP
22+阅读 · 2019年6月20日
元学习(Meta-Learning) 综述及五篇顶会论文推荐
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
9+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
7+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
14+阅读 · 2008年12月31日
Arxiv
0+阅读 · 4月23日
Arxiv
136+阅读 · 2018年10月8日
VIP会员
最新内容
学习数据的几何:形状空间分析数学综述
专知会员服务
6+阅读 · 6月17日
定向能反无人机系统最新发展动态
专知会员服务
7+阅读 · 6月17日
从燃煤战舰到算法战争:水面指挥的永恒要求
专知会员服务
4+阅读 · 6月17日
相关基金
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
9+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
7+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
14+阅读 · 2008年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员