Dynamic event prediction, using joint modeling of survival time and longitudinal variables, is extremely useful in personalized medicine. However, the estimation of joint models including many longitudinal markers is still a computational challenge because of the high number of random effects and parameters to be estimated. In this paper, we propose a model averaging strategy to combine predictions from several joint models for the event, including one longitudinal marker only or pairwise longitudinal markers. The prediction is computed as the weighted mean of the predictions from the one-marker or two-marker models, with the time-dependent weights estimated by minimizing the time-dependent Brier score. This method enables us to combine a large number of predictions issued from joint models to achieve a reliable and accurate individual prediction. Advantages and limits of the proposed methods are highlighted in a simulation study by comparison with the predictions from well-specified and misspecified all-marker joint models as well as the one-marker and two-marker joint models. Using the PBC2 data set, the method is used to predict the risk of death in patients with primary biliary cirrhosis. The method is also used to analyze a French cohort study called the 3C data. In our study, seventeen longitudinal markers are considered to predict the risk of death.


翻译:利用生存时间与纵向变量的联合建模进行动态事件预测,在个性化医疗中极具价值。然而,包含多个纵向标志物的联合模型因其需要估计大量随机效应和参数,在计算上仍面临挑战。本文提出一种模型平均策略,通过整合多个仅包含单一纵向标志物或成对纵向标志物的联合模型预测结果来实现事件预测。预测值由单标志物或双标志物模型的预测结果加权平均得到,其随时间变化的权重通过最小化时间依赖性Brier评分进行估计。该方法能够整合大量来自联合模型的预测结果,从而获得可靠且准确的个体化预测。通过模拟研究,将所提方法与正确设定及错误设定的全标志物联合模型、单标志物及双标志物联合模型的预测结果进行比较,凸显了该方法的优势与局限。利用PBC2数据集,该方法被用于预测原发性胆汁性肝硬化患者的死亡风险,并应用于法国3C队列研究的数据分析。在本研究中,共采用十七个纵向标志物进行死亡风险预测。

1
下载
关闭预览

相关内容

ACM/IEEE第23届模型驱动工程语言和系统国际会议,是模型驱动软件和系统工程的首要会议系列,由ACM-SIGSOFT和IEEE-TCSE支持组织。自1998年以来,模型涵盖了建模的各个方面,从语言和方法到工具和应用程序。模特的参加者来自不同的背景,包括研究人员、学者、工程师和工业专业人士。MODELS 2019是一个论坛,参与者可以围绕建模和模型驱动的软件和系统交流前沿研究成果和创新实践经验。今年的版本将为建模社区提供进一步推进建模基础的机会,并在网络物理系统、嵌入式系统、社会技术系统、云计算、大数据、机器学习、安全、开源等新兴领域提出建模的创新应用以及可持续性。 官网链接:http://www.modelsconference.org/
Linux导论,Introduction to Linux,96页ppt
专知会员服务
82+阅读 · 2020年7月26日
【ACL2020】多模态信息抽取,365页ppt
专知会员服务
151+阅读 · 2020年7月6日
强化学习最新教程,17页pdf
专知会员服务
182+阅读 · 2019年10月11日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
基于深度元学习的因果推断新方法
图与推荐
12+阅读 · 2020年7月21日
RL解决'BipedalWalkerHardcore-v2' (SOTA)
CreateAMind
31+阅读 · 2019年7月17日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
Layer Normalization原理及其TensorFlow实现
深度学习每日摘要
32+阅读 · 2017年6月17日
基于LDA的主题模型实践(三)
机器学习深度学习实战原创交流
23+阅读 · 2015年10月12日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Arxiv
69+阅读 · 2022年9月7日
Arxiv
18+阅读 · 2021年3月16日
Augmentation for small object detection
Arxiv
13+阅读 · 2019年2月19日
VIP会员
相关资讯
基于深度元学习的因果推断新方法
图与推荐
12+阅读 · 2020年7月21日
RL解决'BipedalWalkerHardcore-v2' (SOTA)
CreateAMind
31+阅读 · 2019年7月17日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
Layer Normalization原理及其TensorFlow实现
深度学习每日摘要
32+阅读 · 2017年6月17日
基于LDA的主题模型实践(三)
机器学习深度学习实战原创交流
23+阅读 · 2015年10月12日
相关基金
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员