"mdendro" is an R package that provides a comprehensive collection of linkage methods for agglomerative hierarchical clustering on a matrix of proximity data (distances or similarities), returning a multifurcated dendrogram or multidendrogram. Multidendrograms can group more than two clusters at the same time, solving the nonuniqueness problem that arises when there are ties in the data. This problem causes that different binary dendrograms are possible depending both on the order of the input data and on the criterion used to break ties. Weighted and unweighted versions of the most common linkage methods are included in the package, which also implements two parametric linkage methods. In addition, package "mdendro" provides five descriptive measures to analyze the resulting dendrograms: cophenetic correlation coefficient, space distortion ratio, agglomerative coefficient, chaining coefficient and tree balance.


翻译:“mdendro”是一个R语言工具包,提供了面向邻近数据矩阵(距离或相似度)进行凝聚层次聚类的全面链接方法集合,可生成多叉树状图或多聚树图。多聚树图能够同时合并两个以上聚类,解决了数据存在并列值时产生的非唯一性问题——该问题会导致根据输入数据顺序及破并列准则的不同而生成不同的二叉树状图。工具包包含最常用链接方法的加权与未加权版本,同时实现两种参数化链接方法。此外,“mdendro”工具包提供五种描述性指标用于分析生成的树状图:共表相关系数、空间畸变比、凝聚系数、链式系数与树结构平衡度。

0
下载
关闭预览

相关内容

IJCAI2022《对抗序列决策》教程,164页ppt
专知会员服务
48+阅读 · 2022年7月27日
专知会员服务
67+阅读 · 2021年7月18日
专知会员服务
135+阅读 · 2021年6月18日
【ACL2020】多模态信息抽取,365页ppt
专知会员服务
151+阅读 · 2020年7月6日
强化学习最新教程,17页pdf
专知会员服务
182+阅读 · 2019年10月11日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
RL解决'BipedalWalkerHardcore-v2' (SOTA)
CreateAMind
31+阅读 · 2019年7月17日
Github项目推荐 | PyTorch 中文手册 (pytorch handbook)
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
CVE-2018-7600 - Drupal 7.x 远程代码执行exp
黑客工具箱
14+阅读 · 2018年4月17日
强化学习族谱
CreateAMind
26+阅读 · 2017年8月2日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
4+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
5+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
Arxiv
0+阅读 · 2023年11月8日
VIP会员
最新内容
世界模型入门:从序贯决策到通用智能体
专知会员服务
6+阅读 · 10月24日
军事域更好使用人工智能的实用指南
专知会员服务
9+阅读 · 10月22日
《衡量语言模型中的作战规划能力》
专知会员服务
14+阅读 · 10月20日
Maven智能系统:帕兰提尔军事人工智能平台详解
专知会员服务
16+阅读 · 10月20日
《测试自动化框架在敏捷软件开发中的角色》
专知会员服务
8+阅读 · 10月20日
俄罗斯如何拦截乌克兰无人机与巡航导弹
专知会员服务
12+阅读 · 10月15日
《武器-目标分配问题:精确与近似求解算法》
专知会员服务
19+阅读 · 10月15日
相关资讯
相关基金
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
4+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
5+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员