Dominic LaBella,Ujjwal Baid,Omaditya Khanna,Shan McBurney-Lin,Ryan McLean,Pierre Nedelec,Arif Rashid,Nourel Hoda Tahon,Talissa Altes,Radhika Bhalerao,Yaseen Dhemesh,Devon Godfrey,Fathi Hilal,Scott Floyd,Anastasia Janas,Anahita Fathi Kazerooni,John Kirkpatrick,Collin Kent,Florian Kofler,Kevin Leu,Nazanin Maleki,Bjoern Menze,Maxence Pajot,Zachary J. Reitman,Jeffrey D. Rudie,Rachit Saluja,Yury Velichko,Chunhao Wang,Pranav Warman,Maruf Adewole,Jake Albrecht,Udunna Anazodo,Syed Muhammad Anwar,Timothy Bergquist,Sully Francis Chen,Verena Chung,Gian-Marco Conte,Farouk Dako,James Eddy,Ivan Ezhov,Nastaran Khalili,Juan Eugenio Iglesias,Zhifan Jiang,Elaine Johanson,Koen Van Leemput,Hongwei Bran Li,Marius George Linguraru,Xinyang Liu,Aria Mahtabfar,Zeke Meier,Ahmed W. Moawad,John Mongan,Marie Piraud,Russell Takeshi Shinohara,Walter F. Wiggins,Aly H. Abayazeed,Rachel Akinola,András Jakab,Michel Bilello,Maria Correia de Verdier,Priscila Crivellaro,Christos Davatzikos,Keyvan Farahani,John Freymann,Christopher Hess,Raymond Huang,Philipp Lohmann,Mana Moassefi,Matthew W. Pease,Phillipp Vollmuth,Nico Sollmann,David Diffley,Khanak K. Nandolia,Daniel I. Warren,Ali Hussain,Pascal Fehringer,Yulia Bronstein,Lisa Deptula,Evan G. Stein,Mahsa Taherzadeh,Eduardo Portela de Oliveira,Aoife Haughey,Marinos Kontzialis,Luca Saba,Benjamin Turner,Melanie M. T. Brüßeler,Shehbaz Ansari,Athanasios Gkampenis,David Maximilian Weiss,Aya Mansour,Islam H. Shawali,Nikolay Yordanov,Joel M. Stein,Roula Hourani,Mohammed Yahya Moshebah,Ahmed Magdy Abouelatta,Tanvir Rizvi,Klara Willms,Dann C. Martin,Abdullah Okar,Gennaro D'Anna,Ahmed Taha,Yasaman Sharifi,Shahriar Faghani,Dominic Kite,Marco Pinho,Muhammad Ammar Haider,Alejandro Aristizabal,Alexandros Karargyris,Hasan Kassem,Sarthak Pati,Micah Sheller,Michelle Alonso-Basanta,Javier Villanueva-Meyer,Andreas M. Rauschecker,Ayman Nada,Mariam Aboian,Adam E. Flanders,Benedikt Wiestler,Spyridon Bakas,Evan Calabrese
Dominic LaBella,Ujjwal Baid,Omaditya Khanna,Shan McBurney-Lin,Ryan McLean,Pierre Nedelec,Arif Rashid,Nourel Hoda Tahon,Talissa Altes,Radhika Bhalerao,Yaseen Dhemesh,Devon Godfrey,Fathi Hilal,Scott Floyd,Anastasia Janas,Anahita Fathi Kazerooni,John Kirkpatrick,Collin Kent,Florian Kofler,Kevin Leu,Nazanin Maleki,Bjoern Menze,Maxence Pajot,Zachary J. Reitman,Jeffrey D. Rudie,Rachit Saluja,Yury Velichko,Chunhao Wang,Pranav Warman,Maruf Adewole,Jake Albrecht,Udunna Anazodo,Syed Muhammad Anwar,Timothy Bergquist,Sully Francis Chen,Verena Chung,Gian-Marco Conte,Farouk Dako,James Eddy,Ivan Ezhov,Nastaran Khalili,Juan Eugenio Iglesias,Zhifan Jiang,Elaine Johanson,Koen Van Leemput,Hongwei Bran Li,Marius George Linguraru,Xinyang Liu,Aria Mahtabfar,Zeke Meier,Ahmed W. Moawad,John Mongan,Marie Piraud,Russell Takeshi Shinohara,Walter F. Wiggins,Aly H. Abayazeed,Rachel Akinola,András Jakab,Michel Bilello,Maria Correia de Verdier,Priscila Crivellaro,Christos Davatzikos,Keyvan Farahani,John Freymann,Christopher Hess,Raymond Huang,Philipp Lohmann,Mana Moassefi,Matthew W. Pease,Phillipp Vollmuth,Nico Sollmann,David Diffley,Khanak K. Nandolia,Daniel I. Warren,Ali Hussain,Pascal Fehringer,Yulia Bronstein,Lisa Deptula,Evan G. Stein,Mahsa Taherzadeh,Eduardo Portela de Oliveira,Aoife Haughey,Marinos Kontzialis,Luca Saba,Benjamin Turner,Melanie M. T. Brüßeler,Shehbaz Ansari,Athanasios Gkampenis,David Maximilian Weiss,Aya Mansour,Islam H. Shawali,Nikolay Yordanov,Joel M. Stein,Roula Hourani,Mohammed Yahya Moshebah,Ahmed Magdy Abouelatta,Tanvir Rizvi,Klara Willms,Dann C. Martin,Abdullah Okar,Gennaro D'Anna,Ahmed Taha,Yasaman Sharifi,Shahriar Faghani,Dominic Kite,Marco Pinho,Muhammad Ammar Haider,Alejandro Aristizabal,Alexandros Karargyris,Hasan Kassem,Sarthak Pati,Micah Sheller,Michelle Alonso-Basanta,Javier Villanueva-Meyer,Andreas M. Rauschecker,Ayman Nada,Mariam Aboian,Adam E. Flanders,Benedikt Wiestler,Spyridon Bakas,Evan Calabrese

We describe the design and results from the BraTS 2023 Intracranial Meningioma Segmentation Challenge. The BraTS Meningioma Challenge differed from prior BraTS Glioma challenges in that it focused on meningiomas, which are typically benign extra-axial tumors with diverse radiologic and anatomical presentation and a propensity for multiplicity. Nine participating teams each developed deep-learning automated segmentation models using image data from the largest multi-institutional systematically expert annotated multilabel multi-sequence meningioma MRI dataset to date, which included 1000 training set cases, 141 validation set cases, and 283 hidden test set cases. Each case included T2, T2/FLAIR, T1, and T1Gd brain MRI sequences with associated tumor compartment labels delineating enhancing tumor, non-enhancing tumor, and surrounding non-enhancing T2/FLAIR hyperintensity. Participant automated segmentation models were evaluated and ranked based on a scoring system evaluating lesion-wise metrics including dice similarity coefficient (DSC) and 95% Hausdorff Distance. The top ranked team had a lesion-wise median dice similarity coefficient (DSC) of 0.976, 0.976, and 0.964 for enhancing tumor, tumor core, and whole tumor, respectively and a corresponding average DSC of 0.899, 0.904, and 0.871, respectively. These results serve as state-of-the-art benchmarks for future pre-operative meningioma automated segmentation algorithms. Additionally, we found that 1286 of 1424 cases (90.3%) had at least 1 compartment voxel abutting the edge of the skull-stripped image edge, which requires further investigation into optimal pre-processing face anonymization steps.


翻译:我们描述了BraTS 2023颅内脑膜瘤分割挑战的设计与结果。此次脑膜瘤挑战与此前的BraTS胶质瘤挑战不同,其聚焦于脑膜瘤——一种通常为良性的轴外肿瘤,具有多样的放射学与解剖学表现,且易出现多发性。九个参赛团队利用迄今为止最大的、多机构系统性专家标注的多标签多序列脑膜瘤MRI数据集(包含1000例训练集、141例验证集和283例隐藏测试集)开发了深度学习自动分割模型。每例数据包含T2、T2/FLAIR、T1和T1Gd脑部MRI序列,并附带肿瘤分区标签,分别标注增强肿瘤、非增强肿瘤及周围非增强T2/FLAIR高信号区域。参赛者的自动分割模型基于评分系统进行评估与排名,该系统评估病灶级指标,包括Dice相似系数(DSC)和95% Hausdorff距离。排名第一的团队在增强肿瘤、肿瘤核心和全肿瘤区域的病灶级中位Dice相似系数(DSC)分别为0.976、0.976和0.964,对应的平均DSC分别为0.899、0.904和0.871。这些结果可作为未来术前脑膜瘤自动分割算法的先进基准。此外,我们发现1424例中有1286例(占90.3%)至少有一个分区体素与颅骨剥离图像边缘相邻,这提示需进一步研究最佳预处理面部匿名化步骤。

0
下载
关闭预览

相关内容

CASES:International Conference on Compilers, Architectures, and Synthesis for Embedded Systems。 Explanation:嵌入式系统编译器、体系结构和综合国际会议。 Publisher:ACM。 SIT: http://dblp.uni-trier.de/db/conf/cases/index.html
Linux导论,Introduction to Linux,96页ppt
专知会员服务
82+阅读 · 2020年7月26日
FlowQA: Grasping Flow in History for Conversational Machine Comprehension
专知会员服务
34+阅读 · 2019年10月18日
Stabilizing Transformers for Reinforcement Learning
专知会员服务
60+阅读 · 2019年10月17日
《DeepGCNs: Making GCNs Go as Deep as CNNs》
专知会员服务
32+阅读 · 2019年10月17日
Keras François Chollet 《Deep Learning with Python 》, 386页pdf
专知会员服务
164+阅读 · 2019年10月12日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
可解释的CNN
CreateAMind
18+阅读 · 2017年10月5日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
From Softmax to Sparsemax-ICML16(1)
KingsGarden
74+阅读 · 2016年11月26日
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
Arxiv
0+阅读 · 2024年6月26日
Arxiv
0+阅读 · 2024年6月25日
Arxiv
19+阅读 · 2022年7月29日
VIP会员
最新内容
人工智能赋能无人机:俄乌战争(万字长文)
专知会员服务
4+阅读 · 今天6:56
国外海军作战管理系统与作战训练系统
专知会员服务
2+阅读 · 今天4:16
美军条令《海军陆战队规划流程(2026版)》
专知会员服务
9+阅读 · 今天3:36
《压缩式分布式交互仿真标准》120页
专知会员服务
4+阅读 · 今天3:21
《电子战数据交换模型研究报告》
专知会员服务
6+阅读 · 今天3:13
《基于Transformer的异常舰船导航识别与跟踪》80页
《低数据领域军事目标检测模型研究》
专知会员服务
6+阅读 · 今天2:37
【CMU博士论文】物理世界的视觉感知与深度理解
专知会员服务
10+阅读 · 4月22日
伊朗战争停火期间美军关键弹药状况分析
专知会员服务
8+阅读 · 4月22日
电子战革命:塑造战场的十年突破(2015–2025)
相关资讯
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
可解释的CNN
CreateAMind
18+阅读 · 2017年10月5日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
From Softmax to Sparsemax-ICML16(1)
KingsGarden
74+阅读 · 2016年11月26日
相关基金
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员