Public drug-protein bioactivity resources commonly identify targets by UniProt accession, although one accession may represent distinct experimental sequences. We present Curate-DTI, a construct-aware dataset derived from the 1 July 2026 BindingDB export, with IC50, Ki, Kd and EC50 processed independently. The release contains 2,919,717 measurements, 1,291,872 standardized ligands, 9,668 sequence-defined protein entities and 2,275,683 endpoint-specific interactions spanning 8,336 reviewed UniProt accessions. Protein entities combine the accession with the reported experimental sequence, preserving constructs that accession-only processing would merge. Across the four endpoints, 4,204 endpoint-specific ligand-accession groups showed different classification labels across sequence-defined protein entities. Exact and inequality-qualified observations provide relation-aware classification evidence, whereas regression targets use exact values only. Connected Parquet tables preserve individual measurements, standardized structures, protein sequences, aggregated interactions and available assay and source provenance. The resource supports endpoint-specific classification and regression while allowing users to select molecular representations, protein representations and evaluation splits. Preprocessing code, a column dictionary, exclusion reports and validation summaries accompany the release.


翻译:暂无翻译

0
下载
关闭预览

相关内容

数据集,又称为资料集、数据集合或资料集合,是一种由数据所组成的集合。
Data set(或dataset)是一个数据的集合,通常以表格形式出现。每一列代表一个特定变量。每一行都对应于某一成员的数据集的问题。它列出的价值观为每一个变量,如身高和体重的一个物体或价值的随机数。每个数值被称为数据资料。对应于行数,该数据集的数据可能包括一个或多个成员。
ICLR2023:通过提示学习的蛋白质多级结构预训练
专知会员服务
12+阅读 · 2023年11月26日
Cancer Cell综述|AI用于肿瘤学中的多模态数据集成
专知会员服务
35+阅读 · 2022年10月13日
用蛋白语言模型改进蛋白复合物预测
专知会员服务
10+阅读 · 2022年9月25日
综述:基于进化和物理启发建模的计算蛋白设计
专知会员服务
16+阅读 · 2022年9月12日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
论文 | 基于RNN的在线多目标跟踪
七月在线实验室
31+阅读 · 2017年12月27日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
ProtSent: Protein Sentence Transformers
Arxiv
0+阅读 · 10月19日
VIP会员
最新内容
《面向国防领域的大语言模型基准测试与适配》
专知会员服务
16+阅读 · 10月28日
世界模型入门:从序贯决策到通用智能体
专知会员服务
17+阅读 · 10月24日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员