Inferring brain connectivity and structure \textit{in-vivo} requires accurate estimation of the orientation distribution function (ODF), which encodes key local tissue properties. However, estimating the ODF from diffusion MRI (dMRI) signals is a challenging inverse problem due to obstacles such as significant noise, high-dimensional parameter spaces, and sparse angular measurements. In this paper, we address these challenges by proposing a novel deep-learning based methodology for continuous estimation and uncertainty quantification of the spatially varying ODF field. We use a neural field (NF) to parameterize a random series representation of the latent ODFs, implicitly modeling the often ignored but valuable spatial correlation structures in the data, and thereby improving efficiency in sparse and noisy regimes. An analytic approximation to the posterior predictive distribution is derived which can be used to quantify the uncertainty in the ODF estimate at any spatial location, avoiding the need for expensive resampling-based approaches that are typically employed for this purpose. We present empirical evaluations on both synthetic and real in-vivo diffusion data, demonstrating the advantages of our method over existing approaches.


翻译:推断活体大脑的连通性与结构需要准确估计取向分布函数(ODF),该函数编码了关键的局部组织特性。然而,由于显著噪声、高维参数空间以及稀疏角度测量等障碍,从扩散磁共振成像(dMRI)信号中估计ODF是一项具有挑战性的逆问题。本文提出了一种基于深度学习的新型方法,用于实现空间变化ODF场的连续估计与不确定度量化。我们利用神经场(NF)参数化潜在ODF的随机级数表示,隐式建模了数据中常被忽略但宝贵的空间相关结构,从而提升了稀疏与噪声条件下的效率。推导了后验预测分布的解析近似,该近似可用于量化任意空间位置ODF估计的不确定度,避免了通常为此采用的昂贵重采样方法。我们在合成数据与真实活体扩散数据上进行了实证评估,证明了本方法相对于现有方法的优势。

0
下载
关闭预览

相关内容

FlowQA: Grasping Flow in History for Conversational Machine Comprehension
专知会员服务
34+阅读 · 2019年10月18日
Stabilizing Transformers for Reinforcement Learning
专知会员服务
60+阅读 · 2019年10月17日
《DeepGCNs: Making GCNs Go as Deep as CNNs》
专知会员服务
32+阅读 · 2019年10月17日
Keras François Chollet 《Deep Learning with Python 》, 386页pdf
专知会员服务
164+阅读 · 2019年10月12日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
Single-Shot Object Detection with Enriched Semantics
统计学习与视觉计算组
14+阅读 · 2018年8月29日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
VIP会员
最新内容
学习数据的几何:形状空间分析数学综述
专知会员服务
7+阅读 · 6月17日
定向能反无人机系统最新发展动态
专知会员服务
7+阅读 · 6月17日
从燃煤战舰到算法战争:水面指挥的永恒要求
专知会员服务
5+阅读 · 6月17日
相关资讯
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
29+阅读 · 2019年5月18日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
Single-Shot Object Detection with Enriched Semantics
统计学习与视觉计算组
14+阅读 · 2018年8月29日
STRCF for Visual Object Tracking
统计学习与视觉计算组
15+阅读 · 2018年5月29日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
相关基金
国家自然科学基金
2+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员