The integration of neural-network-based systems into clinical practice is limited by challenges related to domain generalization and robustness. The computer vision community established benchmarks such as ImageNet-C as a fundamental prerequisite to measure progress towards those challenges. Similar datasets are largely absent in the medical imaging community which lacks a comprehensive benchmark that spans across imaging modalities and applications. To address this gap, we create and open-source MedMNIST-C, a benchmark dataset based on the MedMNIST+ collection covering 12 datasets and 9 imaging modalities. We simulate task and modality-specific image corruptions of varying severity to comprehensively evaluate the robustness of established algorithms against real-world artifacts and distribution shifts. We further provide quantitative evidence that our simple-to-use artificial corruptions allow for highly performant, lightweight data augmentation to enhance model robustness. Unlike traditional, generic augmentation strategies, our approach leverages domain knowledge, exhibiting significantly higher robustness when compared to widely adopted methods. By introducing MedMNIST-C and open-sourcing the corresponding library allowing for targeted data augmentations, we contribute to the development of increasingly robust methods tailored to the challenges of medical imaging. The code is available at https://github.com/francescodisalvo05/medmnistc-api}{github.com/francescodisalvo05/medmnistc-api .


翻译:神经网络系统融入临床实践受到领域泛化与鲁棒性相关挑战的限制。计算机视觉社区建立了如ImageNet-C等基准,作为衡量应对这些挑战进展的基础前提。医学影像社区则普遍缺乏类似数据集,缺少跨成像模态与应用的综合基准。为填补这一空白,我们创建并开源了MedMNIST-C——一个基于MedMNIST+集合的基准数据集,涵盖12个数据集与9种成像模态。我们模拟了不同严重程度的任务与模态特异性图像损坏,以全面评估现有算法对真实世界伪影与分布偏移的鲁棒性。我们进一步提供定量证据,表明我们易于使用的人工损坏方法能够实现高性能、轻量级的数据增强,从而提升模型鲁棒性。与传统的通用增强策略不同,我们的方法利用领域知识,在鲁棒性上显著优于广泛采用的方法。通过引入MedMNIST-C并开源支持针对性数据增强的相应库,我们为开发更适应医学影像挑战的鲁棒方法做出贡献。代码发布于https://github.com/francescodisalvo05/medmnistc-api。

0
下载
关闭预览

相关内容

FlowQA: Grasping Flow in History for Conversational Machine Comprehension
专知会员服务
34+阅读 · 2019年10月18日
Keras François Chollet 《Deep Learning with Python 》, 386页pdf
专知会员服务
164+阅读 · 2019年10月12日
强化学习最新教程,17页pdf
专知会员服务
182+阅读 · 2019年10月11日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
41+阅读 · 2019年10月9日
RL解决'BipedalWalkerHardcore-v2' (SOTA)
CreateAMind
31+阅读 · 2019年7月17日
灾难性遗忘问题新视角:迁移-干扰平衡
CreateAMind
17+阅读 · 2019年7月6日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Arxiv
19+阅读 · 2021年4月8日
Arxiv
18+阅读 · 2021年3月16日
VIP会员
最新内容
以色列军事技术对美国军力发展的持续性赋能
专知会员服务
5+阅读 · 今天8:46
《深度强化学习在兵棋推演中的应用》40页报告
专知会员服务
8+阅读 · 今天5:37
《多域作战面临复杂现实》
专知会员服务
6+阅读 · 今天5:35
《印度的多域作战:条令与能力发展》报告
专知会员服务
2+阅读 · 今天5:24
人工智能赋能无人机:俄乌战争(万字长文)
专知会员服务
7+阅读 · 4月23日
国外海军作战管理系统与作战训练系统
专知会员服务
3+阅读 · 4月23日
相关资讯
RL解决'BipedalWalkerHardcore-v2' (SOTA)
CreateAMind
31+阅读 · 2019年7月17日
灾难性遗忘问题新视角:迁移-干扰平衡
CreateAMind
17+阅读 · 2019年7月6日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
18+阅读 · 2018年12月24日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
Focal Loss for Dense Object Detection
统计学习与视觉计算组
12+阅读 · 2018年3月15日
相关基金
国家自然科学基金
13+阅读 · 2017年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
47+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
6+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员