Meta-analytical models are typically formulated as a mixed-effects model where the sampling variances of the effect sizes are treated as known. In principle, such models could be fitted with standard mixed-modelling software such as the glmmTMB R package. This general-purpose package for generalized linear mixed models (GLMMs) provides flexibility in distributions and random effect covariance structures through the Template Model Builder (TMB). However, incorporating known sampling variances in the conventional inverse-variance formulation of meta-analysis was previously not easily accomplished in glmmTMB. Here, we introduce equalto, a new covariance structure in glmmTMB that allows users to supply a known sampling error variance-covariance matrix when fitting meta-analytic models. This enables explicit modelling of heteroscedasticity and dependence among sampling errors. The new implementation provides an alternative way to fit meta-analytic models, convenient for users already familiar with glmmTMB. Using simulations, we show that the new implementation produces model estimates identical to those from the established metafor package and illustrate its applicability with published meta-analyses in medicine, evolutionary ecology, and the social sciences. Further, this novel implementation in glmmTMB supports more flexible modelling of meta-analytical data, expanding the R toolkit available for evidence synthesis.


翻译:暂无翻译

0
下载
关闭预览

相关内容

【ICML2024】揭示Graph Transformers 中的过全局化问题
专知会员服务
21+阅读 · 2024年5月27日
Meta-Transformer:多模态学习的统一框架
专知会员服务
59+阅读 · 2023年7月21日
【元图(Meta-Graph):元学习小样本连接预测】
专知会员服务
65+阅读 · 2020年5月31日
元学习(Meta Learning)最全论文、视频、书籍资源整理
深度学习与NLP
22+阅读 · 2019年6月20日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
From Softmax to Sparsemax-ICML16(1)
KingsGarden
74+阅读 · 2016年11月26日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
4+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
Arxiv
0+阅读 · 4月17日
Arxiv
14+阅读 · 2019年9月11日
Arxiv
136+阅读 · 2018年10月8日
VIP会员
相关主题
最新内容
DeepSeek 版Claude Code,免费小白安装教程来了!
专知会员服务
7+阅读 · 5月5日
《美空军条令出版物 2-0:情报(2026版)》
专知会员服务
12+阅读 · 5月5日
帕兰提尔 Gotham:一个游戏规则改变器
专知会员服务
6+阅读 · 5月5日
【综述】 机器人学习中的世界模型:全面综述
专知会员服务
11+阅读 · 5月4日
伊朗的导弹-无人机行动及其对美国威慑的影响
相关资讯
元学习(Meta Learning)最全论文、视频、书籍资源整理
深度学习与NLP
22+阅读 · 2019年6月20日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
27+阅读 · 2019年5月22日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
18+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
44+阅读 · 2019年1月3日
meta learning 17年:MAML SNAIL
CreateAMind
11+阅读 · 2019年1月2日
From Softmax to Sparsemax-ICML16(1)
KingsGarden
74+阅读 · 2016年11月26日
相关基金
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
2+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
4+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员